Ризик інфікування BA.5 серед людей, які зазнали попередніх варіантів SARS-CoV-2

Редактору:

Останніми місяцями омікрон (B.1.1.529) став домінуючим варіантом важкого гострого респіраторного синдрому коронавірусу 2 (SARS-CoV-2), демонструючи певний ступінь ухилення імунітету.¹ Основні підваріанти омікрон, BA.1 і BA.2, поступово витісняються BA.5 у багатьох країнах, можливо, через підвищену трансмісивність і часткове ухилення імунітету, спричинене BA.1 і BA.2.^2,3 Захист, який забезпечує BA.1 від зараження підзмінною BA.5, є критично важливим, оскільки адаптовані вакцини в клінічних випробуваннях базуються на BA.1.

Португалія була однією з перших країн, які постраждали від домінування BA.5. Ми використали Національний реєстр коронавірусної хвороби 2019 (Covid-19) (SINAVE), щоб розрахувати ризик інфікування BA.5 серед суб’єктів із задокументованою інфекцією попередніми варіантами, включаючи BA.1 і BA.2. Реєстр включає всі випадки, зареєстровані в країні, незалежно від клінічної картини.

Фігура 1. Фігура 1. Захисний вплив попередньої інфекції SARS-CoV-2 на інфікування варіантом Omicron BA.5.

Як показано на панелі (а), ми визначили періоди (різними кольорами), в які один варіант був представлений у більш ніж 90% зразків ізолятів (дані національного коронавируса 2 важкого гострого респіраторного синдрому). [SARS-CoV-2] контроль генетичного різноманіття⁴). Періоди, виділені сірим кольором, позначають час, коли в обігу перебувала більше ніж одна змінна. Враховуючи відносно повільний перехід між домінуванням варіанту omicron BA.1 і домінуванням варіанту omicron BA.2, ми об’єднали BA.1 і BA.2 в аналізі. Ми не включили суб’єктів, інфікованих протягом 90 днів до домінування субфактора omicron BA.5. Панель B показує ефективність захисту від інфекції протягом контрольного періоду BA.5 (з 1 червня 2022 р.) серед суб’єктів з однією інфекцією в періоди домінування різних варіантів, як показано на панелі A, порівняно з суб’єктами без документально підтверджених інфекції станом на 1 червня. Люди з інфекцією до 1 червня не були включені в дослідження. 𝙸 Стовпчики представляють 95% довірчі інтервали.

Національний генетичний нагляд за SARS-CoV-2 визначив періоди, коли різні варіанти становили понад 90% ізолятів.⁴ Ми ідентифікували всіх суб’єктів, у яких було перше інфікування протягом контрольних періодів для кожної змінної, щоб розрахувати їхній ризик інфікування протягом контрольного періоду BA.5 (Малюнок 1а). Ми об’єднали BA.1 і BA.2 через повільний перехід між двома підзмінними в сукупності. Нарешті, ми розрахували ризик BA.5 для популяції, яка не мала задокументованих інфекцій до домінування BA.5 (1 червня 2022 р.).

Ми виявили, що попередня інфекція SARS-CoV-2 мала захисний ефект проти інфекції BA.5 (Малюнок 1b і таблиці S1 у додатковому додатку, доступному з повним текстом цього листа на NEJM.org), і цей захист був максимальним для попереднього зараження BA.1 або BA.2. Ці дані слід розглядати в контексті пенетрантної інфекції в високовакцинованій популяції, враховуючи, що понад 98% досліджуваної популяції в Португалії пройшли первинну серію вакцинації до 2022 року.

Дизайн дослідження не може усунути всі спонукальні фактори (див. розділ обговорення в Додатковому додатку). Крім того, одним з обмежень є передбачуваний ефект зниження імунітету в популяції з гетерозиготним імунітетом (попередня інфекція та вакцинація). Ми виявили, що інфекція BA.1 або BA.2 у вакцинованих суб’єктів забезпечує вищий захист від BA.5, ніж інфекція варіантами пре-омікрон, що відповідає нещодавньому звіту про негативний дизайн тесту.⁵ Однак зараження BA.1 або BA.2 відбулося ближче до періоду домінування BA.5, ніж зараження більш ранніми варіантами. Існує думка, що захист від попередньої інфекції BA.1 або BA.2 є дуже низьким, враховуючи велику кількість інфекцій BA.5 серед осіб, раніше інфікованих вірусом BA.1 або BA.2. Наші дані свідчать про те, що це сприйняття, ймовірно, є результатом більшої групи суб’єктів з інфекцією BA.1 або BA.2 порівняно з інфекцією за іншими підзмінними, і не підтверджується даними.

Загалом ми виявили, що проникаюча інфекція варіантом BA.5 була менш імовірною серед людей з попередньою історією SARS-CoV-2 у високовакцинованій популяції, особливо для попередніх інфекцій BA.1 або BA.2, ніж серед неінфікованих суб’єктів. . .

Жоао Малато, Массачусетс.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лісабон, Португалія

Рой М. Рібейро, Філ Д.
Національна лабораторія Лос-Аламос, Лос-Аламос, Нью-Мексико

Педро П. Лейте, доктор медичних наук
Педро Касака, доктор медичних наук
Євгенія Фернандес, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Лісабон, Португалія

Карлос Антунес, Ph.D.
Лісабонський університет, Лісабон, Португалія

Вальтер Р. Фонсека, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Лісабон, Португалія

Мануель К. Гомес, доктор філософії
Лісабонський університет, Лісабон, Португалія

Луїс Грака, доктор медичних наук, Філ Д.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лісабон, Португалія
[email protected]

Це повідомлення було опубліковано 31 серпня 2022 року на NEJM.org.