Дослідження, проведене вченими з Інституту великих даних Оксфордського університету, об’єднує людські геноми з різних джерел – як стародавніх, так і сучасних ДНК – для кращого розуміння людської історії та розвитку.
Так само, як генеалогічне дерево показує, як людина пов’язана зі своїми батьками чи братами і сестрами, воно є спадковим Провідний автор Ентоні Вайлдер Вонс, який зараз є докторантом Інституту Брода в Массачусетському технологічному інституті та Гарварді, сказав CNN, що генеалогія розкриває спільні гени двох людей.
Таким чином, він може показати, які точки в геномі людини мають спільні гени, а де вони відрізняються.
«Простіше кажучи, ми створили найбільше генеалогічне дерево людини в історії», – сказав Вонс. «У нас є єдина лінія, яка простежує предків усього людства і показує, як ми всі споріднені один з одним сьогодні».
Ресурс означає, що будь-хто, хто має доступ до їх генетичної інформації, може дізнатися, коли їхні предки переїхали в конкретне місце, і чому вони мають певні гени.
«Це в основному розуміння всієї історії людської історії, записаної в наших генах», — сказав Вонс.
Однак виявилося, що важко об’єднати різні бази даних, об’єднати стародавні та сучасні геноми та знайти способи роботи з такою великою кількістю даних.
Команда з Оксфорда розробила алгоритми, які дозволяють включати геном у свій інструмент.
«Це було одне з наших найбільших нововведень», — сказав Вонс.
Це, за його словами, дозволило їм побудувати структуру того, що вони називали «генеалогією людини», про яку теоретично говорили майже 30 років.
“Ми в основному намагаємося прорвати завісу і подивитися, як це виглядає”, – додав він.
На сьогоднішній день гени 3609 людей були секвеновані з 215 груп, деяким з яких більше 100 000 років. Цей метод дозволяє в майбутньому поширити це число на мільйони геномів.
Стаття підтверджує сучасні висновки про історію людства, включаючи те, що більшість людської еволюції відбувалося в Африці раніше великий Вонс сказав, що рух за межі континенту був приблизно 70 000 років тому.
“Це багато в чому підтвердження”, – сказав він, додавши, що дані показують, що найбільша генетична різноманітність в Африці і що найдавніші предки людини знаходяться на континенті. «Зрозуміло, що більша частина еволюції людини відбулася в Африці».
«Перший проект» генетичної генеалогії
Однак дані також викликають питання.
“Це наводить на думку про невідомі міграції, які відбувалися в минулому”, – сказав Вонс.
Наприклад, є деякі докази того, що предки людей були в Північній Америці раніше, ніж вважалося раніше, хоча для виявлення невідомих міграцій необхідні додаткові дослідження, сказав він.
Венс порівняв дослідження з «першим проектом» людської генетичної генеалогії і сказав, що більше роботи допоможе зробити його більш точним і всеосяжним.
Додавання більше геномів допоможе це зробити, але для досягнення повної точності нам потрібно отримати геном кожної людини, яка коли-небудь жила, сказав він, що неможливо.
Вонс сказав, що він сподівається, що інші дослідники в цій галузі будуть використовувати ресурс, який доступний для завантаження разом з інструкціями щодо використання, як основу, щоб відповісти на більш конкретні питання про міграцію в певних географічних районах.
“Це буде дійсно багатий ресурс для майбутніх досліджень історії еволюції людини”, – сказав він.
Сам Уонс працює з дослідниками ШІ, щоб спробувати отримати точніші оцінки того, коли і де жили предки людей.
Цей метод також можна використовувати для розробки генеалогії будь-якого організму, включаючи такі захворювання, як SARS-CoV-2, коронавірус, що викликає Covid-19, а Вонс планує вивчити зв’язок між генетикою та хворобою.
«Велика обіцянка» еволюційних досліджень
Андерс Бергстром, докторант еволюційної геноміки в Інституті Френсіса Кріка в Лондоні, сказав CNN, що дослідження дає новий спосіб оцінити зв’язок нашої ДНК.
«Висновок деревоподібних ліній, що зв’язують ДНК між різними людьми, є святим Граалем геноміки. Він ніколи не буде повністю вирішений, але цей новий обчислювальний метод робить важливий крок вперед у цій проблемі», – сказав він електронною поштою.
«Генеалогія, яку вони виводять, дає неймовірно багате уявлення про людське генетичне різноманіття та історію. Зараз у геноміці багато можливостей, які відкривають ці нові обчислювальні підходи».
Понтус Скоглунд, керівник групи лабораторії стародавнього геному в Інституті Френсіса Кріка, сказав CNN, що дослідження показує, що такий підхід може поширюватися на великі бази даних.
«Тому вони мають велику користь для медичної генетики та еволюційних досліджень, і ця стаття є величезним кроком у цьому напрямку», — сказав Скоглунд електронною поштою.
“Професійний вирішувач проблем. Тонко чарівний любитель бекону. Геймер. Завзятий алкогольний ботанік. Музичний трейлер”
